Protein–RNA interactions for Protein: Q62470

Itga3, Integrin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga3Q62470 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms