Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
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Ss18Q62280 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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