Protein–RNA interactions for Protein: Q62277

Syp, Synaptophysin, mousemouse

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Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SypQ62277 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SypQ62277 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SypQ62277 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SypQ62277 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SypQ62277 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SypQ62277 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SypQ62277 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SypQ62277 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SypQ62277 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SypQ62277 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SypQ62277 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SypQ62277 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SypQ62277 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SypQ62277 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SypQ62277 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SypQ62277 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SypQ62277 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SypQ62277 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SypQ62277 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SypQ62277 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SypQ62277 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SypQ62277 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SypQ62277 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SypQ62277 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SypQ62277 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SypQ62277 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SypQ62277 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SypQ62277 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SypQ62277 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SypQ62277 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SypQ62277 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SypQ62277 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SypQ62277 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SypQ62277 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SypQ62277 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SypQ62277 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SypQ62277 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SypQ62277 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SypQ62277 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SypQ62277 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SypQ62277 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SypQ62277 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SypQ62277 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SypQ62277 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SypQ62277 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SypQ62277 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SypQ62277 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SypQ62277 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SypQ62277 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SypQ62277 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SypQ62277 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SypQ62277 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SypQ62277 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SypQ62277 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SypQ62277 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SypQ62277 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SypQ62277 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SypQ62277 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SypQ62277 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SypQ62277 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SypQ62277 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SypQ62277 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SypQ62277 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SypQ62277 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SypQ62277 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SypQ62277 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SypQ62277 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SypQ62277 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SypQ62277 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SypQ62277 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SypQ62277 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SypQ62277 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SypQ62277 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SypQ62277 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SypQ62277 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SypQ62277 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SypQ62277 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SypQ62277 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SypQ62277 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SypQ62277 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SypQ62277 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SypQ62277 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SypQ62277 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SypQ62277 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SypQ62277 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SypQ62277 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SypQ62277 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SypQ62277 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SypQ62277 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SypQ62277 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SypQ62277 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SypQ62277 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SypQ62277 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SypQ62277 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SypQ62277 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SypQ62277 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SypQ62277 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SypQ62277 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SypQ62277 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SypQ62277 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms