Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Kdm5dQ62240 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Kdm5dQ62240 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Kdm5dQ62240 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Kdm5dQ62240 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Kdm5dQ62240 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Kdm5dQ62240 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Kdm5dQ62240 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Kdm5dQ62240 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Kdm5dQ62240 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Kdm5dQ62240 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Kdm5dQ62240 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Kdm5dQ62240 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Kdm5dQ62240 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Kdm5dQ62240 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Kdm5dQ62240 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Kdm5dQ62240 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Kdm5dQ62240 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Kdm5dQ62240 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Kdm5dQ62240 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Kdm5dQ62240 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Kdm5dQ62240 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Kdm5dQ62240 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Kdm5dQ62240 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Kdm5dQ62240 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Kdm5dQ62240 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Kdm5dQ62240 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Kdm5dQ62240 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Kdm5dQ62240 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Kdm5dQ62240 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Kdm5dQ62240 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Kdm5dQ62240 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Kdm5dQ62240 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Kdm5dQ62240 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Kdm5dQ62240 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Kdm5dQ62240 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Kdm5dQ62240 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Kdm5dQ62240 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Kdm5dQ62240 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Kdm5dQ62240 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Kdm5dQ62240 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Kdm5dQ62240 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Kdm5dQ62240 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Kdm5dQ62240 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Kdm5dQ62240 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Kdm5dQ62240 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Kdm5dQ62240 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Kdm5dQ62240 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Kdm5dQ62240 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Kdm5dQ62240 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Kdm5dQ62240 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Kdm5dQ62240 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Kdm5dQ62240 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Kdm5dQ62240 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Kdm5dQ62240 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Kdm5dQ62240 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Kdm5dQ62240 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Kdm5dQ62240 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Kdm5dQ62240 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Kdm5dQ62240 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Kdm5dQ62240 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Kdm5dQ62240 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Kdm5dQ62240 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Kdm5dQ62240 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Kdm5dQ62240 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Kdm5dQ62240 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Kdm5dQ62240 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
Kdm5dQ62240 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Kdm5dQ62240 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Kdm5dQ62240 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Kdm5dQ62240 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Kdm5dQ62240 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Kdm5dQ62240 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Kdm5dQ62240 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Kdm5dQ62240 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Kdm5dQ62240 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Kdm5dQ62240 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Kdm5dQ62240 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Kdm5dQ62240 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Kdm5dQ62240 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Kdm5dQ62240 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Kdm5dQ62240 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Kdm5dQ62240 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Kdm5dQ62240 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Kdm5dQ62240 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Kdm5dQ62240 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Kdm5dQ62240 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Kdm5dQ62240 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Kdm5dQ62240 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Kdm5dQ62240 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Kdm5dQ62240 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Kdm5dQ62240 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Kdm5dQ62240 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Kdm5dQ62240 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Kdm5dQ62240 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Kdm5dQ62240 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Kdm5dQ62240 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Kdm5dQ62240 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Kdm5dQ62240 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Kdm5dQ62240 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.7 ms