Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbm38Q62176 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbm38Q62176 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbm38Q62176 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbm38Q62176 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbm38Q62176 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbm38Q62176 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbm38Q62176 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbm38Q62176 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbm38Q62176 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbm38Q62176 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbm38Q62176 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbm38Q62176 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbm38Q62176 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbm38Q62176 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbm38Q62176 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbm38Q62176 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbm38Q62176 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbm38Q62176 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbm38Q62176 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbm38Q62176 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbm38Q62176 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbm38Q62176 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbm38Q62176 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbm38Q62176 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbm38Q62176 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbm38Q62176 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbm38Q62176 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbm38Q62176 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbm38Q62176 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbm38Q62176 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbm38Q62176 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Rbm38Q62176 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Rbm38Q62176 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbm38Q62176 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbm38Q62176 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbm38Q62176 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbm38Q62176 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbm38Q62176 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbm38Q62176 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbm38Q62176 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbm38Q62176 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbm38Q62176 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbm38Q62176 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbm38Q62176 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbm38Q62176 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbm38Q62176 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbm38Q62176 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbm38Q62176 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbm38Q62176 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbm38Q62176 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbm38Q62176 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbm38Q62176 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbm38Q62176 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbm38Q62176 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Rbm38Q62176 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbm38Q62176 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Rbm38Q62176 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Rbm38Q62176 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Rbm38Q62176 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbm38Q62176 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbm38Q62176 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbm38Q62176 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbm38Q62176 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbm38Q62176 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbm38Q62176 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbm38Q62176 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbm38Q62176 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbm38Q62176 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbm38Q62176 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbm38Q62176 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbm38Q62176 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbm38Q62176 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbm38Q62176 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbm38Q62176 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbm38Q62176 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbm38Q62176 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbm38Q62176 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbm38Q62176 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbm38Q62176 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbm38Q62176 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbm38Q62176 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbm38Q62176 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbm38Q62176 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbm38Q62176 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbm38Q62176 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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