Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms