Protein–RNA interactions for Protein: Q62101

Prkd1, Serine/threonine-protein kinase D1, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd1Q62101 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prkd1Q62101 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prkd1Q62101 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prkd1Q62101 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prkd1Q62101 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prkd1Q62101 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prkd1Q62101 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prkd1Q62101 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prkd1Q62101 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Prkd1Q62101 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prkd1Q62101 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prkd1Q62101 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Prkd1Q62101 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prkd1Q62101 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prkd1Q62101 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prkd1Q62101 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prkd1Q62101 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prkd1Q62101 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prkd1Q62101 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prkd1Q62101 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkd1Q62101 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkd1Q62101 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkd1Q62101 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkd1Q62101 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkd1Q62101 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkd1Q62101 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkd1Q62101 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkd1Q62101 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkd1Q62101 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkd1Q62101 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkd1Q62101 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkd1Q62101 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkd1Q62101 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkd1Q62101 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkd1Q62101 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkd1Q62101 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkd1Q62101 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkd1Q62101 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkd1Q62101 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkd1Q62101 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkd1Q62101 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkd1Q62101 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkd1Q62101 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkd1Q62101 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkd1Q62101 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkd1Q62101 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkd1Q62101 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkd1Q62101 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkd1Q62101 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkd1Q62101 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkd1Q62101 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkd1Q62101 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkd1Q62101 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkd1Q62101 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkd1Q62101 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkd1Q62101 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkd1Q62101 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkd1Q62101 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkd1Q62101 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkd1Q62101 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkd1Q62101 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkd1Q62101 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkd1Q62101 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkd1Q62101 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkd1Q62101 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkd1Q62101 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkd1Q62101 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkd1Q62101 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkd1Q62101 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkd1Q62101 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkd1Q62101 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkd1Q62101 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkd1Q62101 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkd1Q62101 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkd1Q62101 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkd1Q62101 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkd1Q62101 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkd1Q62101 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkd1Q62101 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkd1Q62101 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkd1Q62101 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkd1Q62101 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkd1Q62101 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkd1Q62101 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkd1Q62101 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prkd1Q62101 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prkd1Q62101 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prkd1Q62101 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prkd1Q62101 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prkd1Q62101 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prkd1Q62101 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prkd1Q62101 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prkd1Q62101 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prkd1Q62101 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Prkd1Q62101 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prkd1Q62101 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prkd1Q62101 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prkd1Q62101 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prkd1Q62101 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prkd1Q62101 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135.5 ms