Protein–RNA interactions for Protein: Q61999

Odf1, Outer dense fiber protein 1, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Odf1Q61999 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Odf1Q61999 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Odf1Q61999 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Odf1Q61999 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Odf1Q61999 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Odf1Q61999 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Odf1Q61999 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Odf1Q61999 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Odf1Q61999 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Odf1Q61999 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Odf1Q61999 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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Odf1Q61999 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Odf1Q61999 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Odf1Q61999 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Odf1Q61999 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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Odf1Q61999 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Odf1Q61999 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Odf1Q61999 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Odf1Q61999 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Odf1Q61999 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Odf1Q61999 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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Odf1Q61999 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Odf1Q61999 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Odf1Q61999 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Odf1Q61999 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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Odf1Q61999 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
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Odf1Q61999 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Odf1Q61999 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
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Odf1Q61999 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Odf1Q61999 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Odf1Q61999 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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Odf1Q61999 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Odf1Q61999 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Odf1Q61999 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Odf1Q61999 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Odf1Q61999 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Odf1Q61999 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Odf1Q61999 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Odf1Q61999 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Odf1Q61999 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Odf1Q61999 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Odf1Q61999 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Odf1Q61999 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Odf1Q61999 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Odf1Q61999 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Odf1Q61999 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Odf1Q61999 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Odf1Q61999 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Odf1Q61999 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Odf1Q61999 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Odf1Q61999 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Odf1Q61999 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
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