Protein–RNA interactions for Protein: Q61990

Pcbp2, Poly(rC)-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp2Q61990 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcbp2Q61990 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcbp2Q61990 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcbp2Q61990 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcbp2Q61990 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcbp2Q61990 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcbp2Q61990 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcbp2Q61990 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcbp2Q61990 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcbp2Q61990 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcbp2Q61990 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcbp2Q61990 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcbp2Q61990 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pcbp2Q61990 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pcbp2Q61990 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pcbp2Q61990 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pcbp2Q61990 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pcbp2Q61990 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pcbp2Q61990 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pcbp2Q61990 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pcbp2Q61990 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pcbp2Q61990 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pcbp2Q61990 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pcbp2Q61990 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pcbp2Q61990 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pcbp2Q61990 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pcbp2Q61990 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pcbp2Q61990 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pcbp2Q61990 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pcbp2Q61990 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pcbp2Q61990 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pcbp2Q61990 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pcbp2Q61990 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pcbp2Q61990 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pcbp2Q61990 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pcbp2Q61990 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pcbp2Q61990 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pcbp2Q61990 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pcbp2Q61990 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pcbp2Q61990 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pcbp2Q61990 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pcbp2Q61990 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pcbp2Q61990 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pcbp2Q61990 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pcbp2Q61990 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pcbp2Q61990 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pcbp2Q61990 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pcbp2Q61990 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pcbp2Q61990 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pcbp2Q61990 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pcbp2Q61990 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pcbp2Q61990 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pcbp2Q61990 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pcbp2Q61990 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pcbp2Q61990 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pcbp2Q61990 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pcbp2Q61990 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pcbp2Q61990 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pcbp2Q61990 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pcbp2Q61990 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pcbp2Q61990 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pcbp2Q61990 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pcbp2Q61990 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pcbp2Q61990 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pcbp2Q61990 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pcbp2Q61990 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pcbp2Q61990 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pcbp2Q61990 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pcbp2Q61990 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pcbp2Q61990 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pcbp2Q61990 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pcbp2Q61990 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pcbp2Q61990 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pcbp2Q61990 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pcbp2Q61990 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pcbp2Q61990 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pcbp2Q61990 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pcbp2Q61990 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pcbp2Q61990 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pcbp2Q61990 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pcbp2Q61990 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pcbp2Q61990 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pcbp2Q61990 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pcbp2Q61990 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pcbp2Q61990 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pcbp2Q61990 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pcbp2Q61990 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pcbp2Q61990 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pcbp2Q61990 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pcbp2Q61990 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pcbp2Q61990 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pcbp2Q61990 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pcbp2Q61990 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pcbp2Q61990 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pcbp2Q61990 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pcbp2Q61990 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pcbp2Q61990 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pcbp2Q61990 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pcbp2Q61990 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pcbp2Q61990 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms