Protein–RNA interactions for Protein: Q61937

Npm1, Nucleophosmin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm1Q61937 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Npm1Q61937 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Npm1Q61937 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Npm1Q61937 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Npm1Q61937 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Npm1Q61937 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Npm1Q61937 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Npm1Q61937 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Npm1Q61937 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Npm1Q61937 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Npm1Q61937 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Npm1Q61937 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Npm1Q61937 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Npm1Q61937 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Npm1Q61937 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Npm1Q61937 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Npm1Q61937 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Npm1Q61937 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Npm1Q61937 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Npm1Q61937 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Npm1Q61937 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Npm1Q61937 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Npm1Q61937 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Npm1Q61937 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Npm1Q61937 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Npm1Q61937 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Npm1Q61937 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Npm1Q61937 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Npm1Q61937 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Npm1Q61937 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Npm1Q61937 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Npm1Q61937 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Npm1Q61937 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Npm1Q61937 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Npm1Q61937 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Npm1Q61937 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Npm1Q61937 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Npm1Q61937 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Npm1Q61937 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Npm1Q61937 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Npm1Q61937 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Npm1Q61937 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Npm1Q61937 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Npm1Q61937 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Npm1Q61937 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Npm1Q61937 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Npm1Q61937 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Npm1Q61937 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Npm1Q61937 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Npm1Q61937 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Npm1Q61937 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Npm1Q61937 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Npm1Q61937 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Npm1Q61937 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Npm1Q61937 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Npm1Q61937 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Npm1Q61937 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Npm1Q61937 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Npm1Q61937 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Npm1Q61937 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Npm1Q61937 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Npm1Q61937 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Npm1Q61937 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Npm1Q61937 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Npm1Q61937 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Npm1Q61937 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Npm1Q61937 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Npm1Q61937 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Npm1Q61937 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Npm1Q61937 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Npm1Q61937 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Npm1Q61937 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Npm1Q61937 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Npm1Q61937 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Npm1Q61937 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Npm1Q61937 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Npm1Q61937 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Npm1Q61937 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Npm1Q61937 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Npm1Q61937 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Npm1Q61937 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Npm1Q61937 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Npm1Q61937 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Npm1Q61937 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Npm1Q61937 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Npm1Q61937 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Npm1Q61937 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Npm1Q61937 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Npm1Q61937 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Npm1Q61937 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Npm1Q61937 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Npm1Q61937 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Npm1Q61937 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Npm1Q61937 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Npm1Q61937 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Npm1Q61937 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Npm1Q61937 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Npm1Q61937 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Npm1Q61937 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Npm1Q61937 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms