Protein–RNA interactions for Protein: Q61184

Mtnr1a, Melatonin receptor type 1A, mousemouse

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtnr1aQ61184 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mtnr1aQ61184 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mtnr1aQ61184 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mtnr1aQ61184 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mtnr1aQ61184 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mtnr1aQ61184 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mtnr1aQ61184 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mtnr1aQ61184 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mtnr1aQ61184 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mtnr1aQ61184 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Mtnr1aQ61184 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mtnr1aQ61184 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mtnr1aQ61184 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mtnr1aQ61184 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mtnr1aQ61184 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mtnr1aQ61184 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mtnr1aQ61184 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mtnr1aQ61184 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mtnr1aQ61184 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mtnr1aQ61184 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mtnr1aQ61184 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mtnr1aQ61184 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mtnr1aQ61184 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mtnr1aQ61184 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mtnr1aQ61184 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mtnr1aQ61184 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mtnr1aQ61184 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mtnr1aQ61184 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mtnr1aQ61184 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Mtnr1aQ61184 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mtnr1aQ61184 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mtnr1aQ61184 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mtnr1aQ61184 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mtnr1aQ61184 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mtnr1aQ61184 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mtnr1aQ61184 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mtnr1aQ61184 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mtnr1aQ61184 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mtnr1aQ61184 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mtnr1aQ61184 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mtnr1aQ61184 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mtnr1aQ61184 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mtnr1aQ61184 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mtnr1aQ61184 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mtnr1aQ61184 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mtnr1aQ61184 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mtnr1aQ61184 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mtnr1aQ61184 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mtnr1aQ61184 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mtnr1aQ61184 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mtnr1aQ61184 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mtnr1aQ61184 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mtnr1aQ61184 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mtnr1aQ61184 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mtnr1aQ61184 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mtnr1aQ61184 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mtnr1aQ61184 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Mtnr1aQ61184 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Mtnr1aQ61184 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Mtnr1aQ61184 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mtnr1aQ61184 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Mtnr1aQ61184 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mtnr1aQ61184 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Mtnr1aQ61184 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mtnr1aQ61184 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mtnr1aQ61184 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mtnr1aQ61184 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mtnr1aQ61184 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mtnr1aQ61184 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mtnr1aQ61184 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mtnr1aQ61184 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mtnr1aQ61184 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mtnr1aQ61184 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mtnr1aQ61184 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mtnr1aQ61184 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mtnr1aQ61184 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mtnr1aQ61184 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mtnr1aQ61184 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Mtnr1aQ61184 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mtnr1aQ61184 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mtnr1aQ61184 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mtnr1aQ61184 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mtnr1aQ61184 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mtnr1aQ61184 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mtnr1aQ61184 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Mtnr1aQ61184 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Mtnr1aQ61184 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mtnr1aQ61184 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mtnr1aQ61184 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mtnr1aQ61184 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mtnr1aQ61184 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mtnr1aQ61184 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mtnr1aQ61184 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mtnr1aQ61184 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms