Protein–RNA interactions for Protein: Q61107

Gbp4, Guanylate-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4Q61107 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbp4Q61107 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbp4Q61107 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbp4Q61107 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbp4Q61107 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbp4Q61107 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbp4Q61107 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbp4Q61107 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gbp4Q61107 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gbp4Q61107 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gbp4Q61107 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp4Q61107 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp4Q61107 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp4Q61107 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp4Q61107 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp4Q61107 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp4Q61107 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp4Q61107 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp4Q61107 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp4Q61107 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp4Q61107 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp4Q61107 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp4Q61107 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp4Q61107 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp4Q61107 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp4Q61107 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp4Q61107 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp4Q61107 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp4Q61107 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp4Q61107 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp4Q61107 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp4Q61107 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp4Q61107 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp4Q61107 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp4Q61107 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp4Q61107 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp4Q61107 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp4Q61107 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp4Q61107 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp4Q61107 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp4Q61107 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp4Q61107 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp4Q61107 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp4Q61107 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp4Q61107 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp4Q61107 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp4Q61107 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp4Q61107 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp4Q61107 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp4Q61107 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp4Q61107 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp4Q61107 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp4Q61107 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp4Q61107 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp4Q61107 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp4Q61107 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp4Q61107 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp4Q61107 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp4Q61107 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp4Q61107 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp4Q61107 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp4Q61107 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp4Q61107 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp4Q61107 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp4Q61107 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp4Q61107 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp4Q61107 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp4Q61107 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp4Q61107 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp4Q61107 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp4Q61107 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp4Q61107 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp4Q61107 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp4Q61107 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp4Q61107 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp4Q61107 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp4Q61107 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp4Q61107 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp4Q61107 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp4Q61107 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp4Q61107 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp4Q61107 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp4Q61107 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp4Q61107 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp4Q61107 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp4Q61107 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp4Q61107 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp4Q61107 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp4Q61107 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp4Q61107 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp4Q61107 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp4Q61107 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp4Q61107 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp4Q61107 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp4Q61107 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp4Q61107 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp4Q61107 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp4Q61107 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp4Q61107 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp4Q61107 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms