Protein–RNA interactions for Protein: Q61087

Lamb3, Laminin subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb3Q61087 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms