Protein–RNA interactions for Protein: Q61045

Sim1, Single-minded homolog 1, mousemouse

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Length 765 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sim1Q61045 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sim1Q61045 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sim1Q61045 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sim1Q61045 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sim1Q61045 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sim1Q61045 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sim1Q61045 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sim1Q61045 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sim1Q61045 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sim1Q61045 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sim1Q61045 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sim1Q61045 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sim1Q61045 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sim1Q61045 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sim1Q61045 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sim1Q61045 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sim1Q61045 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sim1Q61045 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sim1Q61045 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sim1Q61045 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sim1Q61045 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sim1Q61045 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sim1Q61045 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sim1Q61045 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sim1Q61045 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sim1Q61045 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sim1Q61045 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sim1Q61045 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sim1Q61045 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sim1Q61045 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sim1Q61045 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sim1Q61045 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sim1Q61045 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sim1Q61045 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sim1Q61045 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sim1Q61045 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sim1Q61045 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sim1Q61045 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sim1Q61045 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sim1Q61045 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Sim1Q61045 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sim1Q61045 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Sim1Q61045 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sim1Q61045 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Sim1Q61045 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sim1Q61045 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sim1Q61045 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sim1Q61045 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Sim1Q61045 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sim1Q61045 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Sim1Q61045 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sim1Q61045 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sim1Q61045 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sim1Q61045 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sim1Q61045 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Sim1Q61045 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sim1Q61045 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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Sim1Q61045 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sim1Q61045 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sim1Q61045 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sim1Q61045 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sim1Q61045 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sim1Q61045 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sim1Q61045 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sim1Q61045 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sim1Q61045 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sim1Q61045 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sim1Q61045 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sim1Q61045 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sim1Q61045 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sim1Q61045 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sim1Q61045 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sim1Q61045 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sim1Q61045 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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