Protein–RNA interactions for Protein: Q61025

Ift20, Intraflagellar transport protein 20 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift20Q61025 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms