Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms