Protein–RNA interactions for Protein: Q60857

Slc6a4, Sodium-dependent serotonin transporter, mousemouse

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Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a4Q60857 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc6a4Q60857 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc6a4Q60857 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc6a4Q60857 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc6a4Q60857 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc6a4Q60857 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc6a4Q60857 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc6a4Q60857 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc6a4Q60857 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc6a4Q60857 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc6a4Q60857 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc6a4Q60857 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc6a4Q60857 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc6a4Q60857 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc6a4Q60857 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc6a4Q60857 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc6a4Q60857 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc6a4Q60857 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc6a4Q60857 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc6a4Q60857 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc6a4Q60857 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc6a4Q60857 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc6a4Q60857 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc6a4Q60857 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc6a4Q60857 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc6a4Q60857 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc6a4Q60857 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc6a4Q60857 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc6a4Q60857 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc6a4Q60857 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc6a4Q60857 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc6a4Q60857 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc6a4Q60857 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc6a4Q60857 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc6a4Q60857 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc6a4Q60857 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc6a4Q60857 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc6a4Q60857 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc6a4Q60857 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc6a4Q60857 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc6a4Q60857 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc6a4Q60857 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc6a4Q60857 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc6a4Q60857 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc6a4Q60857 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc6a4Q60857 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc6a4Q60857 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc6a4Q60857 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc6a4Q60857 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc6a4Q60857 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc6a4Q60857 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc6a4Q60857 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc6a4Q60857 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc6a4Q60857 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc6a4Q60857 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Slc6a4Q60857 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc6a4Q60857 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc6a4Q60857 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc6a4Q60857 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc6a4Q60857 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc6a4Q60857 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Slc6a4Q60857 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc6a4Q60857 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc6a4Q60857 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc6a4Q60857 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc6a4Q60857 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc6a4Q60857 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc6a4Q60857 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc6a4Q60857 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc6a4Q60857 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc6a4Q60857 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc6a4Q60857 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc6a4Q60857 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc6a4Q60857 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc6a4Q60857 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc6a4Q60857 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc6a4Q60857 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc6a4Q60857 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc6a4Q60857 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc6a4Q60857 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc6a4Q60857 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc6a4Q60857 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc6a4Q60857 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc6a4Q60857 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc6a4Q60857 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc6a4Q60857 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc6a4Q60857 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc6a4Q60857 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc6a4Q60857 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc6a4Q60857 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc6a4Q60857 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc6a4Q60857 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc6a4Q60857 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc6a4Q60857 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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