Protein–RNA interactions for Protein: Q60855

Ripk1, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk1Q60855 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ripk1Q60855 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ripk1Q60855 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ripk1Q60855 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ripk1Q60855 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ripk1Q60855 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ripk1Q60855 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms