Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms