Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms