Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Prl8a1-201ENSMUST00000006664 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Cd59a-201ENSMUST00000040423 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms