Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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PtprnQ60673 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprnQ60673 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprnQ60673 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprnQ60673 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprnQ60673 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprnQ60673 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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PtprnQ60673 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprnQ60673 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprnQ60673 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprnQ60673 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprnQ60673 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprnQ60673 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprnQ60673 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprnQ60673 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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PtprnQ60673 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprnQ60673 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprnQ60673 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprnQ60673 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprnQ60673 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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PtprnQ60673 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprnQ60673 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprnQ60673 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprnQ60673 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprnQ60673 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprnQ60673 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprnQ60673 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprnQ60673 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprnQ60673 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprnQ60673 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprnQ60673 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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PtprnQ60673 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprnQ60673 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprnQ60673 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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PtprnQ60673 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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PtprnQ60673 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprnQ60673 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprnQ60673 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprnQ60673 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprnQ60673 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprnQ60673 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprnQ60673 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprnQ60673 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprnQ60673 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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PtprnQ60673 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprnQ60673 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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PtprnQ60673 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprnQ60673 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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PtprnQ60673 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprnQ60673 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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PtprnQ60673 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprnQ60673 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprnQ60673 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprnQ60673 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprnQ60673 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprnQ60673 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprnQ60673 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprnQ60673 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprnQ60673 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprnQ60673 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprnQ60673 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprnQ60673 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprnQ60673 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprnQ60673 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprnQ60673 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprnQ60673 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprnQ60673 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms