Protein–RNA interactions for Protein: Q60596

Xrcc1, DNA repair protein XRCC1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc1Q60596 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Xrcc1Q60596 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Xrcc1Q60596 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Xrcc1Q60596 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Xrcc1Q60596 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Xrcc1Q60596 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Xrcc1Q60596 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Xrcc1Q60596 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Xrcc1Q60596 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Xrcc1Q60596 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Xrcc1Q60596 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Xrcc1Q60596 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Xrcc1Q60596 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Xrcc1Q60596 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Xrcc1Q60596 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Xrcc1Q60596 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Xrcc1Q60596 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Xrcc1Q60596 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Xrcc1Q60596 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Xrcc1Q60596 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Xrcc1Q60596 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Xrcc1Q60596 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Xrcc1Q60596 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Xrcc1Q60596 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Xrcc1Q60596 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Xrcc1Q60596 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Xrcc1Q60596 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Xrcc1Q60596 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Xrcc1Q60596 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Xrcc1Q60596 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Xrcc1Q60596 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Xrcc1Q60596 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Xrcc1Q60596 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Xrcc1Q60596 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Xrcc1Q60596 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Xrcc1Q60596 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Xrcc1Q60596 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Xrcc1Q60596 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Xrcc1Q60596 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Xrcc1Q60596 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Xrcc1Q60596 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Xrcc1Q60596 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Xrcc1Q60596 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Xrcc1Q60596 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Xrcc1Q60596 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Xrcc1Q60596 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Xrcc1Q60596 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Xrcc1Q60596 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Xrcc1Q60596 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Xrcc1Q60596 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Xrcc1Q60596 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Xrcc1Q60596 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Xrcc1Q60596 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Xrcc1Q60596 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Xrcc1Q60596 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Xrcc1Q60596 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Xrcc1Q60596 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Xrcc1Q60596 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Xrcc1Q60596 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Xrcc1Q60596 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Xrcc1Q60596 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Xrcc1Q60596 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Xrcc1Q60596 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Xrcc1Q60596 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Xrcc1Q60596 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Xrcc1Q60596 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Xrcc1Q60596 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Xrcc1Q60596 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Xrcc1Q60596 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Xrcc1Q60596 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Xrcc1Q60596 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Xrcc1Q60596 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Xrcc1Q60596 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Xrcc1Q60596 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Xrcc1Q60596 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Xrcc1Q60596 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Xrcc1Q60596 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Xrcc1Q60596 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Xrcc1Q60596 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Xrcc1Q60596 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Xrcc1Q60596 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Xrcc1Q60596 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Xrcc1Q60596 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Xrcc1Q60596 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Xrcc1Q60596 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Xrcc1Q60596 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Xrcc1Q60596 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Xrcc1Q60596 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Xrcc1Q60596 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Xrcc1Q60596 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Xrcc1Q60596 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Xrcc1Q60596 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Xrcc1Q60596 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Xrcc1Q60596 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Xrcc1Q60596 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Xrcc1Q60596 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Xrcc1Q60596 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Xrcc1Q60596 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Xrcc1Q60596 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Xrcc1Q60596 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms