Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
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Tdrd5Q5VCS6 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms