Protein–RNA interactions for Protein: Q5U462

Cdcp1, CUB domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdcp1Q5U462 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdcp1Q5U462 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdcp1Q5U462 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdcp1Q5U462 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdcp1Q5U462 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdcp1Q5U462 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdcp1Q5U462 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdcp1Q5U462 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdcp1Q5U462 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdcp1Q5U462 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdcp1Q5U462 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdcp1Q5U462 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdcp1Q5U462 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdcp1Q5U462 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdcp1Q5U462 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdcp1Q5U462 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdcp1Q5U462 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdcp1Q5U462 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdcp1Q5U462 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdcp1Q5U462 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdcp1Q5U462 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdcp1Q5U462 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdcp1Q5U462 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdcp1Q5U462 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdcp1Q5U462 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdcp1Q5U462 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdcp1Q5U462 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdcp1Q5U462 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdcp1Q5U462 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdcp1Q5U462 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdcp1Q5U462 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdcp1Q5U462 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdcp1Q5U462 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdcp1Q5U462 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdcp1Q5U462 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdcp1Q5U462 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdcp1Q5U462 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdcp1Q5U462 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdcp1Q5U462 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdcp1Q5U462 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdcp1Q5U462 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdcp1Q5U462 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdcp1Q5U462 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdcp1Q5U462 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdcp1Q5U462 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdcp1Q5U462 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdcp1Q5U462 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdcp1Q5U462 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdcp1Q5U462 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdcp1Q5U462 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdcp1Q5U462 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdcp1Q5U462 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdcp1Q5U462 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdcp1Q5U462 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdcp1Q5U462 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdcp1Q5U462 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdcp1Q5U462 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdcp1Q5U462 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdcp1Q5U462 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdcp1Q5U462 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdcp1Q5U462 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdcp1Q5U462 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdcp1Q5U462 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdcp1Q5U462 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdcp1Q5U462 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdcp1Q5U462 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdcp1Q5U462 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdcp1Q5U462 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdcp1Q5U462 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdcp1Q5U462 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdcp1Q5U462 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdcp1Q5U462 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdcp1Q5U462 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdcp1Q5U462 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdcp1Q5U462 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdcp1Q5U462 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdcp1Q5U462 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdcp1Q5U462 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdcp1Q5U462 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdcp1Q5U462 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdcp1Q5U462 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdcp1Q5U462 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdcp1Q5U462 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdcp1Q5U462 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdcp1Q5U462 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdcp1Q5U462 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdcp1Q5U462 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdcp1Q5U462 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdcp1Q5U462 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdcp1Q5U462 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdcp1Q5U462 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdcp1Q5U462 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdcp1Q5U462 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdcp1Q5U462 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdcp1Q5U462 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdcp1Q5U462 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdcp1Q5U462 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdcp1Q5U462 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdcp1Q5U462 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdcp1Q5U462 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms