Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim38Q5SZ99 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim38Q5SZ99 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim38Q5SZ99 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim38Q5SZ99 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim38Q5SZ99 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim38Q5SZ99 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim38Q5SZ99 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim38Q5SZ99 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim38Q5SZ99 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim38Q5SZ99 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim38Q5SZ99 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim38Q5SZ99 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim38Q5SZ99 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim38Q5SZ99 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim38Q5SZ99 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim38Q5SZ99 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim38Q5SZ99 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim38Q5SZ99 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim38Q5SZ99 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim38Q5SZ99 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim38Q5SZ99 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim38Q5SZ99 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim38Q5SZ99 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim38Q5SZ99 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim38Q5SZ99 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim38Q5SZ99 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim38Q5SZ99 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim38Q5SZ99 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim38Q5SZ99 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim38Q5SZ99 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim38Q5SZ99 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim38Q5SZ99 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim38Q5SZ99 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim38Q5SZ99 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim38Q5SZ99 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim38Q5SZ99 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim38Q5SZ99 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim38Q5SZ99 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim38Q5SZ99 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim38Q5SZ99 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim38Q5SZ99 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim38Q5SZ99 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim38Q5SZ99 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim38Q5SZ99 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim38Q5SZ99 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim38Q5SZ99 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim38Q5SZ99 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim38Q5SZ99 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim38Q5SZ99 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim38Q5SZ99 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim38Q5SZ99 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim38Q5SZ99 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim38Q5SZ99 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim38Q5SZ99 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim38Q5SZ99 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim38Q5SZ99 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim38Q5SZ99 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim38Q5SZ99 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim38Q5SZ99 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim38Q5SZ99 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim38Q5SZ99 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim38Q5SZ99 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim38Q5SZ99 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim38Q5SZ99 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim38Q5SZ99 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim38Q5SZ99 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim38Q5SZ99 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim38Q5SZ99 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim38Q5SZ99 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim38Q5SZ99 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim38Q5SZ99 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim38Q5SZ99 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim38Q5SZ99 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim38Q5SZ99 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim38Q5SZ99 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim38Q5SZ99 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim38Q5SZ99 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim38Q5SZ99 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim38Q5SZ99 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim38Q5SZ99 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim38Q5SZ99 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim38Q5SZ99 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim38Q5SZ99 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim38Q5SZ99 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim38Q5SZ99 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim38Q5SZ99 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim38Q5SZ99 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim38Q5SZ99 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim38Q5SZ99 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim38Q5SZ99 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim38Q5SZ99 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim38Q5SZ99 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim38Q5SZ99 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim38Q5SZ99 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim38Q5SZ99 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim38Q5SZ99 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim38Q5SZ99 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim38Q5SZ99 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim38Q5SZ99 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim38Q5SZ99 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms