Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tsr1Q5SWD9 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tsr1Q5SWD9 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tsr1Q5SWD9 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tsr1Q5SWD9 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tsr1Q5SWD9 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tsr1Q5SWD9 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tsr1Q5SWD9 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tsr1Q5SWD9 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tsr1Q5SWD9 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tsr1Q5SWD9 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Tsr1Q5SWD9 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tsr1Q5SWD9 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tsr1Q5SWD9 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tsr1Q5SWD9 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tsr1Q5SWD9 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Tsr1Q5SWD9 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tsr1Q5SWD9 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tsr1Q5SWD9 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tsr1Q5SWD9 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tsr1Q5SWD9 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tsr1Q5SWD9 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tsr1Q5SWD9 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tsr1Q5SWD9 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tsr1Q5SWD9 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tsr1Q5SWD9 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tsr1Q5SWD9 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tsr1Q5SWD9 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms