Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psme4Q5SSW2 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psme4Q5SSW2 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psme4Q5SSW2 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psme4Q5SSW2 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psme4Q5SSW2 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psme4Q5SSW2 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psme4Q5SSW2 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Psme4Q5SSW2 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Psme4Q5SSW2 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psme4Q5SSW2 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psme4Q5SSW2 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psme4Q5SSW2 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psme4Q5SSW2 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psme4Q5SSW2 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psme4Q5SSW2 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psme4Q5SSW2 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psme4Q5SSW2 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psme4Q5SSW2 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Psme4Q5SSW2 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Psme4Q5SSW2 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Psme4Q5SSW2 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Psme4Q5SSW2 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psme4Q5SSW2 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psme4Q5SSW2 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psme4Q5SSW2 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psme4Q5SSW2 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psme4Q5SSW2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psme4Q5SSW2 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psme4Q5SSW2 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psme4Q5SSW2 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psme4Q5SSW2 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psme4Q5SSW2 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psme4Q5SSW2 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psme4Q5SSW2 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psme4Q5SSW2 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psme4Q5SSW2 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Psme4Q5SSW2 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psme4Q5SSW2 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psme4Q5SSW2 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Psme4Q5SSW2 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psme4Q5SSW2 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psme4Q5SSW2 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Psme4Q5SSW2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psme4Q5SSW2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psme4Q5SSW2 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psme4Q5SSW2 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psme4Q5SSW2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psme4Q5SSW2 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psme4Q5SSW2 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psme4Q5SSW2 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psme4Q5SSW2 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psme4Q5SSW2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psme4Q5SSW2 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psme4Q5SSW2 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psme4Q5SSW2 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psme4Q5SSW2 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psme4Q5SSW2 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psme4Q5SSW2 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psme4Q5SSW2 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Psme4Q5SSW2 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psme4Q5SSW2 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psme4Q5SSW2 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psme4Q5SSW2 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psme4Q5SSW2 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psme4Q5SSW2 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psme4Q5SSW2 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psme4Q5SSW2 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psme4Q5SSW2 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psme4Q5SSW2 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psme4Q5SSW2 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psme4Q5SSW2 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Psme4Q5SSW2 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psme4Q5SSW2 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psme4Q5SSW2 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psme4Q5SSW2 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Psme4Q5SSW2 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psme4Q5SSW2 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psme4Q5SSW2 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psme4Q5SSW2 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psme4Q5SSW2 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Psme4Q5SSW2 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psme4Q5SSW2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psme4Q5SSW2 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psme4Q5SSW2 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psme4Q5SSW2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psme4Q5SSW2 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psme4Q5SSW2 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psme4Q5SSW2 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psme4Q5SSW2 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psme4Q5SSW2 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psme4Q5SSW2 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psme4Q5SSW2 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psme4Q5SSW2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psme4Q5SSW2 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psme4Q5SSW2 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psme4Q5SSW2 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psme4Q5SSW2 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psme4Q5SSW2 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psme4Q5SSW2 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms