Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms