Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc88aQ5SNZ0 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc88aQ5SNZ0 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc88aQ5SNZ0 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc88aQ5SNZ0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc88aQ5SNZ0 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc88aQ5SNZ0 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc88aQ5SNZ0 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc88aQ5SNZ0 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc88aQ5SNZ0 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc88aQ5SNZ0 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc88aQ5SNZ0 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc88aQ5SNZ0 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc88aQ5SNZ0 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc88aQ5SNZ0 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc88aQ5SNZ0 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc88aQ5SNZ0 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc88aQ5SNZ0 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc88aQ5SNZ0 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc88aQ5SNZ0 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc88aQ5SNZ0 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc88aQ5SNZ0 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc88aQ5SNZ0 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc88aQ5SNZ0 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc88aQ5SNZ0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc88aQ5SNZ0 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc88aQ5SNZ0 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc88aQ5SNZ0 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc88aQ5SNZ0 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc88aQ5SNZ0 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc88aQ5SNZ0 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc88aQ5SNZ0 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc88aQ5SNZ0 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc88aQ5SNZ0 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc88aQ5SNZ0 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc88aQ5SNZ0 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc88aQ5SNZ0 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc88aQ5SNZ0 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc88aQ5SNZ0 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc88aQ5SNZ0 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc88aQ5SNZ0 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc88aQ5SNZ0 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc88aQ5SNZ0 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc88aQ5SNZ0 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc88aQ5SNZ0 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc88aQ5SNZ0 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc88aQ5SNZ0 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc88aQ5SNZ0 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc88aQ5SNZ0 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc88aQ5SNZ0 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc88aQ5SNZ0 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc88aQ5SNZ0 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc88aQ5SNZ0 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc88aQ5SNZ0 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc88aQ5SNZ0 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc88aQ5SNZ0 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc88aQ5SNZ0 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc88aQ5SNZ0 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc88aQ5SNZ0 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc88aQ5SNZ0 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc88aQ5SNZ0 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc88aQ5SNZ0 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc88aQ5SNZ0 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc88aQ5SNZ0 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc88aQ5SNZ0 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc88aQ5SNZ0 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc88aQ5SNZ0 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc88aQ5SNZ0 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc88aQ5SNZ0 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc88aQ5SNZ0 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc88aQ5SNZ0 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc88aQ5SNZ0 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc88aQ5SNZ0 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc88aQ5SNZ0 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc88aQ5SNZ0 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc88aQ5SNZ0 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc88aQ5SNZ0 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc88aQ5SNZ0 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc88aQ5SNZ0 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc88aQ5SNZ0 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc88aQ5SNZ0 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc88aQ5SNZ0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc88aQ5SNZ0 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms