Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJH3

Cdh12, Cadherin-12, mousemouse

Predictions only

Length 794 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh12Q5RJH3 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdh12Q5RJH3 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdh12Q5RJH3 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdh12Q5RJH3 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdh12Q5RJH3 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdh12Q5RJH3 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdh12Q5RJH3 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdh12Q5RJH3 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdh12Q5RJH3 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdh12Q5RJH3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdh12Q5RJH3 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdh12Q5RJH3 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdh12Q5RJH3 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdh12Q5RJH3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdh12Q5RJH3 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdh12Q5RJH3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdh12Q5RJH3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdh12Q5RJH3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdh12Q5RJH3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdh12Q5RJH3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdh12Q5RJH3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdh12Q5RJH3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdh12Q5RJH3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdh12Q5RJH3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdh12Q5RJH3 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdh12Q5RJH3 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms