Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Trim41Q5NCC3 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Trim41Q5NCC3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Trim41Q5NCC3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Trim41Q5NCC3 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Trim41Q5NCC3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Trim41Q5NCC3 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Trim41Q5NCC3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Trim41Q5NCC3 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Trim41Q5NCC3 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Trim41Q5NCC3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Trim41Q5NCC3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Trim41Q5NCC3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Trim41Q5NCC3 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Trim41Q5NCC3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Trim41Q5NCC3 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Trim41Q5NCC3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Trim41Q5NCC3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trim41Q5NCC3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trim41Q5NCC3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trim41Q5NCC3 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Trim41Q5NCC3 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trim41Q5NCC3 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trim41Q5NCC3 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trim41Q5NCC3 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trim41Q5NCC3 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trim41Q5NCC3 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trim41Q5NCC3 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trim41Q5NCC3 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trim41Q5NCC3 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trim41Q5NCC3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trim41Q5NCC3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trim41Q5NCC3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trim41Q5NCC3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trim41Q5NCC3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Trim41Q5NCC3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Trim41Q5NCC3 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Trim41Q5NCC3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Trim41Q5NCC3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Trim41Q5NCC3 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Trim41Q5NCC3 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Trim41Q5NCC3 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Trim41Q5NCC3 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Trim41Q5NCC3 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Trim41Q5NCC3 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Trim41Q5NCC3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Trim41Q5NCC3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Trim41Q5NCC3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Trim41Q5NCC3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Trim41Q5NCC3 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trim41Q5NCC3 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trim41Q5NCC3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trim41Q5NCC3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trim41Q5NCC3 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Trim41Q5NCC3 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trim41Q5NCC3 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trim41Q5NCC3 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trim41Q5NCC3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trim41Q5NCC3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trim41Q5NCC3 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trim41Q5NCC3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trim41Q5NCC3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trim41Q5NCC3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trim41Q5NCC3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trim41Q5NCC3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trim41Q5NCC3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trim41Q5NCC3 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trim41Q5NCC3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trim41Q5NCC3 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trim41Q5NCC3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trim41Q5NCC3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trim41Q5NCC3 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trim41Q5NCC3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trim41Q5NCC3 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Trim41Q5NCC3 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Trim41Q5NCC3 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trim41Q5NCC3 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Trim41Q5NCC3 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trim41Q5NCC3 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trim41Q5NCC3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trim41Q5NCC3 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trim41Q5NCC3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trim41Q5NCC3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trim41Q5NCC3 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Trim41Q5NCC3 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Trim41Q5NCC3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Trim41Q5NCC3 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Trim41Q5NCC3 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Trim41Q5NCC3 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Trim41Q5NCC3 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Trim41Q5NCC3 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Trim41Q5NCC3 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Trim41Q5NCC3 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Trim41Q5NCC3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Trim41Q5NCC3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Trim41Q5NCC3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Trim41Q5NCC3 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Trim41Q5NCC3 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Trim41Q5NCC3 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Trim41Q5NCC3 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms