Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZH7

Slc38a8, Putative sodium-coupled neutral amino acid transporter 8, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a8Q5HZH7 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc38a8Q5HZH7 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc38a8Q5HZH7 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc38a8Q5HZH7 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc38a8Q5HZH7 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc38a8Q5HZH7 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc38a8Q5HZH7 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc38a8Q5HZH7 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc38a8Q5HZH7 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc38a8Q5HZH7 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc38a8Q5HZH7 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc38a8Q5HZH7 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc38a8Q5HZH7 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc38a8Q5HZH7 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc38a8Q5HZH7 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc38a8Q5HZH7 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc38a8Q5HZH7 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc38a8Q5HZH7 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc38a8Q5HZH7 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc38a8Q5HZH7 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc38a8Q5HZH7 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc38a8Q5HZH7 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc38a8Q5HZH7 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc38a8Q5HZH7 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc38a8Q5HZH7 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc38a8Q5HZH7 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc38a8Q5HZH7 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc38a8Q5HZH7 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc38a8Q5HZH7 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc38a8Q5HZH7 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc38a8Q5HZH7 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc38a8Q5HZH7 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc38a8Q5HZH7 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc38a8Q5HZH7 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc38a8Q5HZH7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc38a8Q5HZH7 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc38a8Q5HZH7 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc38a8Q5HZH7 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc38a8Q5HZH7 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc38a8Q5HZH7 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc38a8Q5HZH7 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc38a8Q5HZH7 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc38a8Q5HZH7 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc38a8Q5HZH7 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc38a8Q5HZH7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc38a8Q5HZH7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc38a8Q5HZH7 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc38a8Q5HZH7 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc38a8Q5HZH7 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc38a8Q5HZH7 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc38a8Q5HZH7 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Slc38a8Q5HZH7 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc38a8Q5HZH7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc38a8Q5HZH7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc38a8Q5HZH7 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc38a8Q5HZH7 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc38a8Q5HZH7 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Slc38a8Q5HZH7 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc38a8Q5HZH7 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Slc38a8Q5HZH7 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Slc38a8Q5HZH7 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Slc38a8Q5HZH7 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc38a8Q5HZH7 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc38a8Q5HZH7 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc38a8Q5HZH7 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Slc38a8Q5HZH7 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Slc38a8Q5HZH7 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc38a8Q5HZH7 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc38a8Q5HZH7 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc38a8Q5HZH7 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc38a8Q5HZH7 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc38a8Q5HZH7 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc38a8Q5HZH7 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc38a8Q5HZH7 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc38a8Q5HZH7 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc38a8Q5HZH7 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc38a8Q5HZH7 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc38a8Q5HZH7 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc38a8Q5HZH7 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc38a8Q5HZH7 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Slc38a8Q5HZH7 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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