Protein–RNA interactions for Protein: Q5GH68

Xkrx, XK-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XkrxQ5GH68 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
XkrxQ5GH68 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
XkrxQ5GH68 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
XkrxQ5GH68 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
XkrxQ5GH68 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
XkrxQ5GH68 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
XkrxQ5GH68 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
XkrxQ5GH68 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
XkrxQ5GH68 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
XkrxQ5GH68 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
XkrxQ5GH68 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
XkrxQ5GH68 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
XkrxQ5GH68 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
XkrxQ5GH68 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
XkrxQ5GH68 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
XkrxQ5GH68 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
XkrxQ5GH68 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
XkrxQ5GH68 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
XkrxQ5GH68 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
XkrxQ5GH68 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
XkrxQ5GH68 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
XkrxQ5GH68 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
XkrxQ5GH68 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
XkrxQ5GH68 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
XkrxQ5GH68 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
XkrxQ5GH68 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
XkrxQ5GH68 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
XkrxQ5GH68 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
XkrxQ5GH68 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
XkrxQ5GH68 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
XkrxQ5GH68 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
XkrxQ5GH68 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
XkrxQ5GH68 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
XkrxQ5GH68 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
XkrxQ5GH68 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
XkrxQ5GH68 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
XkrxQ5GH68 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
XkrxQ5GH68 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
XkrxQ5GH68 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
XkrxQ5GH68 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
XkrxQ5GH68 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
XkrxQ5GH68 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
XkrxQ5GH68 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
XkrxQ5GH68 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
XkrxQ5GH68 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
XkrxQ5GH68 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
XkrxQ5GH68 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
XkrxQ5GH68 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
XkrxQ5GH68 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
XkrxQ5GH68 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
XkrxQ5GH68 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
XkrxQ5GH68 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
XkrxQ5GH68 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
XkrxQ5GH68 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
XkrxQ5GH68 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
XkrxQ5GH68 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
XkrxQ5GH68 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
XkrxQ5GH68 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
XkrxQ5GH68 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
XkrxQ5GH68 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
XkrxQ5GH68 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
XkrxQ5GH68 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
XkrxQ5GH68 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
XkrxQ5GH68 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
XkrxQ5GH68 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
XkrxQ5GH68 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
XkrxQ5GH68 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
XkrxQ5GH68 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
XkrxQ5GH68 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
XkrxQ5GH68 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
XkrxQ5GH68 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
XkrxQ5GH68 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14□□□□□ -0.17
XkrxQ5GH68 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
XkrxQ5GH68 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
XkrxQ5GH68 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
XkrxQ5GH68 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
XkrxQ5GH68 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
XkrxQ5GH68 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
XkrxQ5GH68 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
XkrxQ5GH68 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14□□□□□ -0.17
XkrxQ5GH68 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
XkrxQ5GH68 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
XkrxQ5GH68 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
XkrxQ5GH68 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
XkrxQ5GH68 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
XkrxQ5GH68 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
XkrxQ5GH68 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
XkrxQ5GH68 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14□□□□□ -0.17
XkrxQ5GH68 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
XkrxQ5GH68 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
XkrxQ5GH68 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
XkrxQ5GH68 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
XkrxQ5GH68 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
XkrxQ5GH68 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
XkrxQ5GH68 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
XkrxQ5GH68 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
XkrxQ5GH68 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
XkrxQ5GH68 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
XkrxQ5GH68 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
XkrxQ5GH68 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.8 ms