Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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