Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU02

Usp22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp22Q5DU02 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms