Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTW2

Sfmbt2, Scm-like with four MBT domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt2Q5DTW2 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms