Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

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Length 2,382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Fam208bQ5DTT3 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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