Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTK1

Chsy3, Chondroitin sulfate synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy3Q5DTK1 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chsy3Q5DTK1 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chsy3Q5DTK1 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Chsy3Q5DTK1 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chsy3Q5DTK1 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chsy3Q5DTK1 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Chsy3Q5DTK1 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Chsy3Q5DTK1 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chsy3Q5DTK1 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chsy3Q5DTK1 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chsy3Q5DTK1 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chsy3Q5DTK1 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Chsy3Q5DTK1 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chsy3Q5DTK1 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chsy3Q5DTK1 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Chsy3Q5DTK1 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chsy3Q5DTK1 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chsy3Q5DTK1 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chsy3Q5DTK1 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Chsy3Q5DTK1 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Chsy3Q5DTK1 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chsy3Q5DTK1 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chsy3Q5DTK1 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chsy3Q5DTK1 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Chsy3Q5DTK1 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Chsy3Q5DTK1 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chsy3Q5DTK1 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chsy3Q5DTK1 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Chsy3Q5DTK1 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Chsy3Q5DTK1 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chsy3Q5DTK1 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chsy3Q5DTK1 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chsy3Q5DTK1 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Chsy3Q5DTK1 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chsy3Q5DTK1 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chsy3Q5DTK1 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chsy3Q5DTK1 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chsy3Q5DTK1 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chsy3Q5DTK1 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chsy3Q5DTK1 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chsy3Q5DTK1 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Chsy3Q5DTK1 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chsy3Q5DTK1 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chsy3Q5DTK1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chsy3Q5DTK1 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chsy3Q5DTK1 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chsy3Q5DTK1 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Chsy3Q5DTK1 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chsy3Q5DTK1 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chsy3Q5DTK1 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Chsy3Q5DTK1 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Chsy3Q5DTK1 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chsy3Q5DTK1 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Chsy3Q5DTK1 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chsy3Q5DTK1 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chsy3Q5DTK1 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Chsy3Q5DTK1 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Chsy3Q5DTK1 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Chsy3Q5DTK1 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Chsy3Q5DTK1 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chsy3Q5DTK1 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chsy3Q5DTK1 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Chsy3Q5DTK1 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Chsy3Q5DTK1 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chsy3Q5DTK1 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Chsy3Q5DTK1 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Chsy3Q5DTK1 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chsy3Q5DTK1 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chsy3Q5DTK1 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Chsy3Q5DTK1 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chsy3Q5DTK1 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Chsy3Q5DTK1 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Chsy3Q5DTK1 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Chsy3Q5DTK1 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Chsy3Q5DTK1 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Chsy3Q5DTK1 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Chsy3Q5DTK1 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Chsy3Q5DTK1 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Chsy3Q5DTK1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Chsy3Q5DTK1 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Chsy3Q5DTK1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Chsy3Q5DTK1 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Chsy3Q5DTK1 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Chsy3Q5DTK1 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Chsy3Q5DTK1 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Chsy3Q5DTK1 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Chsy3Q5DTK1 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Chsy3Q5DTK1 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Chsy3Q5DTK1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Chsy3Q5DTK1 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Chsy3Q5DTK1 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Chsy3Q5DTK1 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Chsy3Q5DTK1 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Chsy3Q5DTK1 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Chsy3Q5DTK1 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Chsy3Q5DTK1 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Chsy3Q5DTK1 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Chsy3Q5DTK1 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Chsy3Q5DTK1 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Chsy3Q5DTK1 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms