Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms