Protein–RNA interactions for Protein: Q504M2

Pdp2, MCG53395, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdp2Q504M2 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdp2Q504M2 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdp2Q504M2 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdp2Q504M2 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdp2Q504M2 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdp2Q504M2 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdp2Q504M2 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdp2Q504M2 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdp2Q504M2 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdp2Q504M2 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdp2Q504M2 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdp2Q504M2 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdp2Q504M2 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdp2Q504M2 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdp2Q504M2 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdp2Q504M2 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdp2Q504M2 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdp2Q504M2 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdp2Q504M2 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdp2Q504M2 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdp2Q504M2 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdp2Q504M2 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdp2Q504M2 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdp2Q504M2 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdp2Q504M2 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdp2Q504M2 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdp2Q504M2 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdp2Q504M2 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdp2Q504M2 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdp2Q504M2 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdp2Q504M2 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdp2Q504M2 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdp2Q504M2 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdp2Q504M2 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdp2Q504M2 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdp2Q504M2 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdp2Q504M2 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdp2Q504M2 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdp2Q504M2 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdp2Q504M2 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdp2Q504M2 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdp2Q504M2 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdp2Q504M2 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdp2Q504M2 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdp2Q504M2 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdp2Q504M2 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdp2Q504M2 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdp2Q504M2 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdp2Q504M2 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdp2Q504M2 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdp2Q504M2 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdp2Q504M2 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdp2Q504M2 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdp2Q504M2 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Pdp2Q504M2 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdp2Q504M2 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdp2Q504M2 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Pdp2Q504M2 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdp2Q504M2 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Pdp2Q504M2 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdp2Q504M2 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdp2Q504M2 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdp2Q504M2 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdp2Q504M2 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdp2Q504M2 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdp2Q504M2 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdp2Q504M2 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdp2Q504M2 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdp2Q504M2 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdp2Q504M2 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdp2Q504M2 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdp2Q504M2 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdp2Q504M2 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdp2Q504M2 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdp2Q504M2 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdp2Q504M2 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdp2Q504M2 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdp2Q504M2 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdp2Q504M2 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdp2Q504M2 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdp2Q504M2 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdp2Q504M2 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdp2Q504M2 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdp2Q504M2 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdp2Q504M2 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdp2Q504M2 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdp2Q504M2 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdp2Q504M2 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms