Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0K9

Snhg11, Small nucleolar RNA host gene 11, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snhg11Q4G0K9 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snhg11Q4G0K9 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snhg11Q4G0K9 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snhg11Q4G0K9 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snhg11Q4G0K9 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snhg11Q4G0K9 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snhg11Q4G0K9 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Snhg11Q4G0K9 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snhg11Q4G0K9 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snhg11Q4G0K9 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snhg11Q4G0K9 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Snhg11Q4G0K9 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snhg11Q4G0K9 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snhg11Q4G0K9 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snhg11Q4G0K9 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snhg11Q4G0K9 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snhg11Q4G0K9 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snhg11Q4G0K9 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snhg11Q4G0K9 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snhg11Q4G0K9 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snhg11Q4G0K9 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snhg11Q4G0K9 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snhg11Q4G0K9 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snhg11Q4G0K9 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Snhg11Q4G0K9 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snhg11Q4G0K9 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snhg11Q4G0K9 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snhg11Q4G0K9 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snhg11Q4G0K9 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snhg11Q4G0K9 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snhg11Q4G0K9 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snhg11Q4G0K9 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snhg11Q4G0K9 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snhg11Q4G0K9 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snhg11Q4G0K9 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Snhg11Q4G0K9 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snhg11Q4G0K9 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snhg11Q4G0K9 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snhg11Q4G0K9 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snhg11Q4G0K9 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Snhg11Q4G0K9 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Snhg11Q4G0K9 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snhg11Q4G0K9 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snhg11Q4G0K9 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snhg11Q4G0K9 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snhg11Q4G0K9 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snhg11Q4G0K9 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snhg11Q4G0K9 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snhg11Q4G0K9 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snhg11Q4G0K9 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snhg11Q4G0K9 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snhg11Q4G0K9 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snhg11Q4G0K9 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snhg11Q4G0K9 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snhg11Q4G0K9 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snhg11Q4G0K9 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snhg11Q4G0K9 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snhg11Q4G0K9 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snhg11Q4G0K9 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snhg11Q4G0K9 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snhg11Q4G0K9 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snhg11Q4G0K9 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snhg11Q4G0K9 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snhg11Q4G0K9 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snhg11Q4G0K9 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snhg11Q4G0K9 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snhg11Q4G0K9 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snhg11Q4G0K9 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snhg11Q4G0K9 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snhg11Q4G0K9 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snhg11Q4G0K9 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snhg11Q4G0K9 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snhg11Q4G0K9 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snhg11Q4G0K9 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snhg11Q4G0K9 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
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Snhg11Q4G0K9 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snhg11Q4G0K9 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snhg11Q4G0K9 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snhg11Q4G0K9 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Snhg11Q4G0K9 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snhg11Q4G0K9 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snhg11Q4G0K9 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Snhg11Q4G0K9 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Snhg11Q4G0K9 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snhg11Q4G0K9 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snhg11Q4G0K9 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snhg11Q4G0K9 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snhg11Q4G0K9 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snhg11Q4G0K9 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snhg11Q4G0K9 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snhg11Q4G0K9 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snhg11Q4G0K9 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Snhg11Q4G0K9 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snhg11Q4G0K9 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snhg11Q4G0K9 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snhg11Q4G0K9 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snhg11Q4G0K9 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snhg11Q4G0K9 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snhg11Q4G0K9 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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