Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q7

Pacs2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs2Q3V3Q7 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms