Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc185Q3V118 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc185Q3V118 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc185Q3V118 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc185Q3V118 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc185Q3V118 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc185Q3V118 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc185Q3V118 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms