Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Q1

Dnah12, Dynein heavy chain 12, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 3,086 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnah12Q3V0Q1 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnah12Q3V0Q1 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnah12Q3V0Q1 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnah12Q3V0Q1 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnah12Q3V0Q1 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnah12Q3V0Q1 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnah12Q3V0Q1 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnah12Q3V0Q1 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnah12Q3V0Q1 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnah12Q3V0Q1 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnah12Q3V0Q1 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnah12Q3V0Q1 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnah12Q3V0Q1 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnah12Q3V0Q1 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnah12Q3V0Q1 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnah12Q3V0Q1 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnah12Q3V0Q1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnah12Q3V0Q1 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnah12Q3V0Q1 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnah12Q3V0Q1 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnah12Q3V0Q1 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnah12Q3V0Q1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnah12Q3V0Q1 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnah12Q3V0Q1 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Dnah12Q3V0Q1 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnah12Q3V0Q1 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnah12Q3V0Q1 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
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Dnah12Q3V0Q1 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnah12Q3V0Q1 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnah12Q3V0Q1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnah12Q3V0Q1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnah12Q3V0Q1 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dnah12Q3V0Q1 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dnah12Q3V0Q1 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Dnah12Q3V0Q1 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Dnah12Q3V0Q1 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dnah12Q3V0Q1 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dnah12Q3V0Q1 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Dnah12Q3V0Q1 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnah12Q3V0Q1 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnah12Q3V0Q1 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnah12Q3V0Q1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Dnah12Q3V0Q1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Dnah12Q3V0Q1 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Dnah12Q3V0Q1 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnah12Q3V0Q1 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnah12Q3V0Q1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnah12Q3V0Q1 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnah12Q3V0Q1 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Dnah12Q3V0Q1 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Dnah12Q3V0Q1 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Dnah12Q3V0Q1 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnah12Q3V0Q1 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnah12Q3V0Q1 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Dnah12Q3V0Q1 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnah12Q3V0Q1 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnah12Q3V0Q1 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnah12Q3V0Q1 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnah12Q3V0Q1 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnah12Q3V0Q1 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Dnah12Q3V0Q1 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnah12Q3V0Q1 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnah12Q3V0Q1 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnah12Q3V0Q1 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnah12Q3V0Q1 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnah12Q3V0Q1 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnah12Q3V0Q1 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnah12Q3V0Q1 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnah12Q3V0Q1 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnah12Q3V0Q1 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnah12Q3V0Q1 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnah12Q3V0Q1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnah12Q3V0Q1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms