Protein–RNA interactions for Protein: Q3V089

Rbm44, RNA-binding protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 1,013 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm44Q3V089 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbm44Q3V089 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Rbm44Q3V089 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rbm44Q3V089 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rbm44Q3V089 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rbm44Q3V089 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rbm44Q3V089 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rbm44Q3V089 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rbm44Q3V089 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rbm44Q3V089 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rbm44Q3V089 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rbm44Q3V089 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rbm44Q3V089 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm44Q3V089 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm44Q3V089 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm44Q3V089 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm44Q3V089 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm44Q3V089 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm44Q3V089 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm44Q3V089 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm44Q3V089 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm44Q3V089 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm44Q3V089 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm44Q3V089 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm44Q3V089 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm44Q3V089 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm44Q3V089 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm44Q3V089 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm44Q3V089 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm44Q3V089 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm44Q3V089 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm44Q3V089 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm44Q3V089 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm44Q3V089 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm44Q3V089 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm44Q3V089 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm44Q3V089 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm44Q3V089 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Rbm44Q3V089 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm44Q3V089 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm44Q3V089 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm44Q3V089 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm44Q3V089 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm44Q3V089 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm44Q3V089 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm44Q3V089 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm44Q3V089 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm44Q3V089 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm44Q3V089 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm44Q3V089 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm44Q3V089 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbm44Q3V089 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbm44Q3V089 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbm44Q3V089 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbm44Q3V089 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbm44Q3V089 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbm44Q3V089 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbm44Q3V089 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbm44Q3V089 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbm44Q3V089 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbm44Q3V089 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbm44Q3V089 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbm44Q3V089 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbm44Q3V089 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbm44Q3V089 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbm44Q3V089 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbm44Q3V089 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbm44Q3V089 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbm44Q3V089 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbm44Q3V089 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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