Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZD5

Prdm6, Putative histone-lysine N-methyltransferase PRDM6, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm6Q3UZD5 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Prdm6Q3UZD5 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Prdm6Q3UZD5 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Prdm6Q3UZD5 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Prdm6Q3UZD5 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Prdm6Q3UZD5 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Prdm6Q3UZD5 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Prdm6Q3UZD5 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Prdm6Q3UZD5 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prdm6Q3UZD5 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prdm6Q3UZD5 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prdm6Q3UZD5 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Prdm6Q3UZD5 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prdm6Q3UZD5 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Prdm6Q3UZD5 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prdm6Q3UZD5 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prdm6Q3UZD5 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prdm6Q3UZD5 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prdm6Q3UZD5 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prdm6Q3UZD5 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prdm6Q3UZD5 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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