Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZA1

Rcsd1, CapZ-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcsd1Q3UZA1 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rcsd1Q3UZA1 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rcsd1Q3UZA1 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rcsd1Q3UZA1 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rcsd1Q3UZA1 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rcsd1Q3UZA1 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rcsd1Q3UZA1 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rcsd1Q3UZA1 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rcsd1Q3UZA1 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rcsd1Q3UZA1 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rcsd1Q3UZA1 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rcsd1Q3UZA1 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rcsd1Q3UZA1 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rcsd1Q3UZA1 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rcsd1Q3UZA1 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rcsd1Q3UZA1 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rcsd1Q3UZA1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rcsd1Q3UZA1 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rcsd1Q3UZA1 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rcsd1Q3UZA1 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rcsd1Q3UZA1 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rcsd1Q3UZA1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rcsd1Q3UZA1 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rcsd1Q3UZA1 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rcsd1Q3UZA1 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rcsd1Q3UZA1 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rcsd1Q3UZA1 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rcsd1Q3UZA1 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rcsd1Q3UZA1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rcsd1Q3UZA1 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rcsd1Q3UZA1 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rcsd1Q3UZA1 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rcsd1Q3UZA1 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rcsd1Q3UZA1 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rcsd1Q3UZA1 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rcsd1Q3UZA1 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rcsd1Q3UZA1 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rcsd1Q3UZA1 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rcsd1Q3UZA1 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rcsd1Q3UZA1 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rcsd1Q3UZA1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rcsd1Q3UZA1 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rcsd1Q3UZA1 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rcsd1Q3UZA1 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rcsd1Q3UZA1 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rcsd1Q3UZA1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rcsd1Q3UZA1 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rcsd1Q3UZA1 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rcsd1Q3UZA1 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rcsd1Q3UZA1 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rcsd1Q3UZA1 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rcsd1Q3UZA1 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rcsd1Q3UZA1 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rcsd1Q3UZA1 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rcsd1Q3UZA1 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rcsd1Q3UZA1 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rcsd1Q3UZA1 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rcsd1Q3UZA1 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rcsd1Q3UZA1 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rcsd1Q3UZA1 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rcsd1Q3UZA1 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rcsd1Q3UZA1 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rcsd1Q3UZA1 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rcsd1Q3UZA1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rcsd1Q3UZA1 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rcsd1Q3UZA1 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rcsd1Q3UZA1 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rcsd1Q3UZA1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rcsd1Q3UZA1 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rcsd1Q3UZA1 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rcsd1Q3UZA1 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rcsd1Q3UZA1 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rcsd1Q3UZA1 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rcsd1Q3UZA1 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rcsd1Q3UZA1 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rcsd1Q3UZA1 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rcsd1Q3UZA1 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rcsd1Q3UZA1 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rcsd1Q3UZA1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rcsd1Q3UZA1 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rcsd1Q3UZA1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rcsd1Q3UZA1 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rcsd1Q3UZA1 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rcsd1Q3UZA1 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rcsd1Q3UZA1 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rcsd1Q3UZA1 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rcsd1Q3UZA1 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rcsd1Q3UZA1 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rcsd1Q3UZA1 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rcsd1Q3UZA1 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rcsd1Q3UZA1 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rcsd1Q3UZA1 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rcsd1Q3UZA1 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rcsd1Q3UZA1 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rcsd1Q3UZA1 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rcsd1Q3UZA1 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rcsd1Q3UZA1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rcsd1Q3UZA1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rcsd1Q3UZA1 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rcsd1Q3UZA1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms