Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWL8

Pfdn4, Prefoldin subunit 4, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn4Q3UWL8 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pfdn4Q3UWL8 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pfdn4Q3UWL8 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pfdn4Q3UWL8 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pfdn4Q3UWL8 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pfdn4Q3UWL8 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pfdn4Q3UWL8 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pfdn4Q3UWL8 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfdn4Q3UWL8 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfdn4Q3UWL8 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfdn4Q3UWL8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfdn4Q3UWL8 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfdn4Q3UWL8 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfdn4Q3UWL8 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfdn4Q3UWL8 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfdn4Q3UWL8 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfdn4Q3UWL8 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfdn4Q3UWL8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfdn4Q3UWL8 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfdn4Q3UWL8 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfdn4Q3UWL8 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfdn4Q3UWL8 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfdn4Q3UWL8 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfdn4Q3UWL8 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfdn4Q3UWL8 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfdn4Q3UWL8 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfdn4Q3UWL8 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfdn4Q3UWL8 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pfdn4Q3UWL8 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pfdn4Q3UWL8 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pfdn4Q3UWL8 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pfdn4Q3UWL8 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pfdn4Q3UWL8 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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