Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWA4

Trim40, Tripartite motif-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim40Q3UWA4 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim40Q3UWA4 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim40Q3UWA4 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim40Q3UWA4 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim40Q3UWA4 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim40Q3UWA4 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim40Q3UWA4 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim40Q3UWA4 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim40Q3UWA4 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim40Q3UWA4 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim40Q3UWA4 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim40Q3UWA4 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim40Q3UWA4 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim40Q3UWA4 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim40Q3UWA4 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim40Q3UWA4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim40Q3UWA4 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim40Q3UWA4 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim40Q3UWA4 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim40Q3UWA4 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim40Q3UWA4 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim40Q3UWA4 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim40Q3UWA4 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim40Q3UWA4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim40Q3UWA4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim40Q3UWA4 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim40Q3UWA4 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim40Q3UWA4 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim40Q3UWA4 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim40Q3UWA4 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim40Q3UWA4 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim40Q3UWA4 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim40Q3UWA4 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim40Q3UWA4 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trim40Q3UWA4 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trim40Q3UWA4 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trim40Q3UWA4 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trim40Q3UWA4 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trim40Q3UWA4 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trim40Q3UWA4 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim40Q3UWA4 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim40Q3UWA4 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim40Q3UWA4 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim40Q3UWA4 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim40Q3UWA4 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim40Q3UWA4 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim40Q3UWA4 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim40Q3UWA4 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim40Q3UWA4 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim40Q3UWA4 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim40Q3UWA4 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim40Q3UWA4 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim40Q3UWA4 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim40Q3UWA4 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim40Q3UWA4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim40Q3UWA4 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim40Q3UWA4 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim40Q3UWA4 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim40Q3UWA4 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim40Q3UWA4 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim40Q3UWA4 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim40Q3UWA4 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim40Q3UWA4 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim40Q3UWA4 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim40Q3UWA4 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim40Q3UWA4 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim40Q3UWA4 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim40Q3UWA4 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim40Q3UWA4 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim40Q3UWA4 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim40Q3UWA4 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim40Q3UWA4 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim40Q3UWA4 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim40Q3UWA4 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim40Q3UWA4 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim40Q3UWA4 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim40Q3UWA4 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim40Q3UWA4 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim40Q3UWA4 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim40Q3UWA4 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim40Q3UWA4 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim40Q3UWA4 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim40Q3UWA4 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim40Q3UWA4 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim40Q3UWA4 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim40Q3UWA4 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim40Q3UWA4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim40Q3UWA4 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim40Q3UWA4 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim40Q3UWA4 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim40Q3UWA4 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim40Q3UWA4 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim40Q3UWA4 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim40Q3UWA4 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim40Q3UWA4 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim40Q3UWA4 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim40Q3UWA4 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim40Q3UWA4 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim40Q3UWA4 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim40Q3UWA4 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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